הגרעין במעלה אפרים שלם לו במטרה לקדם מספר נושאים:

1. הנחלת תורה לכלל הציבור, חיזוק הזהות היהודית, וקירוב לבבות בין דתיים לחילונים
2. חיזוק והרחבת התיישבות בבקעת הירדן
3. שותפות משמעותית ביצירת מקום חזק בבקעה מתוך הבנת הרצון וחיבור לכלל האוכלוסיה כולל מענה לציבור החילוני (מוסדות ציבור, פיתוח, התיישבות, קהילה, קליטה,רווחה, נוער וכו')
4. קבוצה שפועלת יחד לקידום מטרות משותפות בשגרה ובחירום
5. שותפות מרכזית ביצירת חוסן קהילתי כללי כשבתוכו נגזרות של חוסן פנים דתי, וחוסן פנים חילוני 
6. מענה תורני בישוב ובבקעה כולה (משפחות אבלות,בר מצוות,חתונות,מרכז משפחה,בימ"ד קהילתי ועוד)
7. יצירת אירועים קהילתיים קבועים סביב מעגל השנה,ואירועים מיוחדים בזמנים מיוחדים.

8. שיתופי פעולה עם הרשות במגוון נושאים במטרה למפות יחד את כלל הצרכים ברחבי המועצה וחתירה ליצירת מענה עבורם